Tóm tắt: Gen Waxy của giống gốc và dòng lúa đột biến được giải trình tự bằng phương pháp Sanger, sau đó sử dụng công cụ BLASTN (Nucleotide Basic Local Alignment Search Tool) để so sánh và phát hiện đột biến. Kết quả tìm thấy 4 đột biến trên vùng mã hóa và 59 đột biến trên vùng không mã hóa. Bốn đột biến trên vùng mã hóa bao gồm: xóa T/- tại vị trí 34 trên vùng exon 3; chèn -/T giữa vị trí 70 và 71 trên vùng exon 3; thay thế C/T ở vị trí 14 trên vùng exon 4; thay thế T/C tại vị trí 115 trên vùng exon 9. Trong tổng số 59 nucleotit đột biến thuộc vùng không mã hóa đáng chú ý nhất là: xóa G/- tại vị trí đầu tiên của intron 6 và thêm 32 trình tự “GGGCCTGCGAAGAACTGGGAGAATGTGCTCCT” ở cuối của intron 12. Để đánh giá và thử nghiệm bước đầu, một chỉ thị ADN mới đã được phát triển dựa trên đột biến thay thế C/T ở vị trí 14 của exon 4 và T/C ở vị trí 115 của exon 9 với mục tiêu nâng cao hiệu quả của chọn giống đột biến liên quan đến hàm lượng amylose.
Từ khóa: Gen Waxy, BGIOSGA022241, hàm lượng amylose, BLASTN, phát triển chỉ thị ADN